Historia Naruto zaczyna się, gdy Czwarty Hokage, jego ojciec, w obronie Konohy przed lisim demonem, o dziewięciu ogonach poświęca swoje życie, wiążąc przy tym bestię w ciele nowo narodzonego chłopca. Naruto może czerpać z niemalże nieskończonych pokładów chakry demona, a rany, które zdobywa po praktycznie każdej walce, goją się w oka mgnieniu. Kiedy w Naruto narasta gniew, czakra demona wydostaję się na zewnątrz i dodaję mu energię, jednocześnie gojąc mu rany. Pierwszy raz w dochodzi do tego w walce z Haku, kiedy rzekomo zabił on Sasuke. Pierwszym stadium tej zmiany są czerwone oczy demona, dłuższe paznokcie, które wtedy wyglądają jak pazury oraz powiększone kły. Im Naruto jest bardziej wściekły tym gorsze stadium przemiany. W następnym stadium czakra tworzy wokół niego powłokę lisa. Im więcej ogonów uformuję się z czakry, tym bardziej Naruto traci nad sobą panowanie i nie odróżnia przyjaciół od wrogów. Pierwszy raz widzimy tą przemianę podczas walki z Sasuke, kiedy ten zamierza dołączyć do Orochimaru, a Naruto usiłuje go powstrzymać. Gdyby w tamtej walce wyrosło więcej niż tylko jeden ogon, przypuszczalnie Naruto mógłby nawet zabić Sasuke. Ostatnie stadium tworzy się kiedy powstaną cztery ogony. Skóra Naruto przypomina wtedy czakrę lub ogień, co powoduję że chłopak wygląda wtedy jak miniaturowa wersja Kyūbiego. Chłopak dochodzi do tej formy podczas walki z Orochimaru. Nie da się go wtedy powstrzymać i nic nie jest w stanie go zranić. Prawdopodobnie gdyby wyrosły wszystkie dziewięć ogonów, przez Naruto zaczął by przemawiać sam Kyūbi, tak jak to miało miejsce z Gaarą, kiedy ten zapadł w udawany sen.

Naruto nie wie nic o swoich rodzicach. O jego matce, której na imię Kushina Uzumaki nie wiadomo wiele oprócz tego, że pochodziła z (nieistniejącego już) Kraju Wiru i była żoną Minato.

Naruto wychował się w samotności, unikany przez mieszkańców wioski. Sam Czwarty Hokage pragnął, aby traktowano go jako bohatera, który uratował wioskę. Dotkliwe kary, które wprowadził trzeci Hokage za mówienie o przeszłości, powstrzymują starszych przed otwartą wrogością, jednakże ich niechęć w stosunku do Naruto przenosi się na jego rówieśników, którzy nie znają prawdy. Fakt ten bardzo martwi Sarutobiego, który podziela opinię swojego następcy i pragnie, aby Naruto żył wolny od uprzedzeń.

Sam Naruto dowiaduje się o zapieczętowanym w nim Kyūbim dopiero w wieku 12 lat, wcześniej sprawiwszy mnóstwo problemów wychowawczych (jednym z wielu jego pomysłów jest pomazanie wyrytych w skale głów Hokage farbą), chcąc w ten sposób zwrócić na siebie uwagę, gdyż nie zna on powodu, dla którego jest unikany. Namiastką ojca stał się dla niego Iruka Umino, nauczyciel z Akademii Ninja. Mimo że rodzice Iruki również zginęli podczas walki z demonem, jako jeden z pierwszych przezwycięża on swoje uprzedzenia i nie wini Naruto za ich śmierć, stając się w ten sposób jego pierwszym i najważniejszym przyjacielem oraz kimś w rodzaju ojca.

Do wyróżników jego osobowości należy hałaśliwość i umiejętność zaskakiwania oraz niczym nie zrażone przekonanie, iż któregoś dnia zostanie największym Hokage ze wszystkich. Osiągnięcie tego celu ma zapewnić mu uznanie mieszkańców Konohy, a żeby je zdobyć, Naruto trenuje bez wytchnienia.

Determinacja chłopaka, jego szacunek i lojalność względem przyjaciół oraz miłość do Konohy sprawiają, że przyciąga do siebie wielu ludzi. Z drugiej strony potrafi też być osobą momentami nieznośną i dziecinną, co przejawia się głównie we wspomnianym wcześniej hałaśliwym zachowaniu, wilczym apetycie oraz zamiłowaniu do śmiesznych przedmiotów (np. portmonetka-żabka lub piżama). Naruto posiada też wspaniały dar (jak nazwał to Kakashi) - każdy, kto go poznaje, zostaje jego przyjacielem.

W Naruto: Shippūden po powrocie do Konohy po dwuipółletnim treningu z Jiraiyą, Naruto zaczyna czynnie rozprawiać się z Akatsuki.Najpierw ratuje z ich garści, Gaare a później dzięki swojej nowej technice, Fūton: Rasenshuriken rozprawia się z Kakuzu.Po poznaniu prawdy o tym iż Jiraiya został zabity przez lidera Akatsuki, Naruto rozpoczyna swój trening, aby miał większe szanse na pokonanie Peina.

* Naruto często kończy swoje wypowiedzi zwrotem dattebayo (jap. だってばよ, dattebayo?), przetłumaczonym na angielski jako "believe it", na polski zaś jako „ten teges” w mandze i „kumalski” w anime.

* Naruto został nazwany na cześć głównego bohatera pierwszej książki Jiraiyi.

* Jiraiya wymyślił imię dla bohatera książki, jedząc ramen.

* Jiraiya jest ojcem chrzestnym Naruto.

* Ulubione jedzenie Naruto to ramen.

* Naruto bardzo szybko nauczył się kontroli żywiołu wiatru, co przeciętnemu ninja zajęłoby co najmniej 6 miesięcy. A to dzięki temu, że Naruto posiada 4 razy więcej chakry niż Kakashi, a z chakrą Kyubiego 100 razy więcej i dlatego, że technika Kage Bunshin no Jutsu wysyła wiadomości zdobyte przez klona do orginalnego ciała.

* Naruto to również nazwa makaronu rybnego - składnika ulubionej potrawy bohatera - ramen.

* Ojcem Naruto jest Czwarty Hokage - Minato Namikaze, a matką Kushina Uzumaki pochodząca z Kraju Wiru, który już nie istnieje.